История королевства имеет начало со II тысячелетия до нашей эры и известна только по эпизодам, сохранившихся после пожара в библиотеке 1827. По существующим легендам на территории Бутана королём Тибета Сонгцен Гампо были построены два монастыря, которые сохранились до сих пор. Многие их них до сих пор остались важнейшими местами паломничества.

В 17-ом столетии Бурунди представляла собой феодальное независимое королевство. Первый ее король Нтаре образовал из отдельных частей королевства единое цельное королевство. Уже при правлении Нтаре Второго королевство быстро начало развиваться и расти, за счет многочисленных сражений с соседними странами и государствами.